Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms