Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PTPRBP23467 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PTPRBP23467 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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PTPRBP23467 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PTPRBP23467 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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