Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms