Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TNNI3P19429 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms