Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGB6P18564 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms