Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
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PTPRAP18433 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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PTPRAP18433 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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