Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH1P12830 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH1P12830 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH1P12830 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH1P12830 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH1P12830 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH1P12830 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH1P12830 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH1P12830 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH1P12830 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH1P12830 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH1P12830 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH1P12830 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH1P12830 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH1P12830 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH1P12830 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH1P12830 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH1P12830 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH1P12830 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH1P12830 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH1P12830 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH1P12830 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH1P12830 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH1P12830 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH1P12830 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH1P12830 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH1P12830 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH1P12830 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH1P12830 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH1P12830 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH1P12830 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH1P12830 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH1P12830 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH1P12830 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH1P12830 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH1P12830 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH1P12830 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH1P12830 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH1P12830 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH1P12830 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH1P12830 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH1P12830 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH1P12830 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH1P12830 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH1P12830 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH1P12830 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH1P12830 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH1P12830 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH1P12830 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH1P12830 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH1P12830 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH1P12830 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH1P12830 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH1P12830 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH1P12830 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH1P12830 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH1P12830 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH1P12830 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH1P12830 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH1P12830 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH1P12830 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH1P12830 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH1P12830 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH1P12830 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH1P12830 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH1P12830 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH1P12830 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH1P12830 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH1P12830 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH1P12830 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH1P12830 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH1P12830 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH1P12830 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH1P12830 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH1P12830 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH1P12830 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH1P12830 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH1P12830 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH1P12830 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH1P12830 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH1P12830 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH1P12830 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH1P12830 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDH1P12830 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH1P12830 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH1P12830 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH1P12830 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH1P12830 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH1P12830 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH1P12830 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH1P12830 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH1P12830 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH1P12830 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH1P12830 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH1P12830 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH1P12830 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH1P12830 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH1P12830 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH1P12830 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH1P12830 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms