Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HKR1P10072 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HKR1P10072 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HKR1P10072 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HKR1P10072 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HKR1P10072 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HKR1P10072 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HKR1P10072 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HKR1P10072 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HKR1P10072 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HKR1P10072 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HKR1P10072 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HKR1P10072 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HKR1P10072 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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