Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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