Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms