Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF10O60809 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms