Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRTO14522 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
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