Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F3O00716 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2F3O00716 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2F3O00716 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2F3O00716 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2F3O00716 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2F3O00716 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
E2F3O00716 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2F3O00716 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2F3O00716 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2F3O00716 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F3O00716 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F3O00716 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F3O00716 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F3O00716 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F3O00716 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F3O00716 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F3O00716 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F3O00716 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F3O00716 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F3O00716 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F3O00716 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F3O00716 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F3O00716 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F3O00716 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F3O00716 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F3O00716 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F3O00716 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F3O00716 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F3O00716 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F3O00716 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F3O00716 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F3O00716 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F3O00716 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F3O00716 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F3O00716 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F3O00716 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F3O00716 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F3O00716 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F3O00716 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms