Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLDN34H7C241 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms