Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms