Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAK1Q9UPV9 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms