Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A2Q9UPR5 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms