Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB23Q9ULC3 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms