Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FBXL4Q9UKA2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms