Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLKQ9UBT6 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms