Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HCN3Q9P1Z3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms