Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms