Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SDHAF3Q9NRP4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SDHAF3Q9NRP4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SDHAF3Q9NRP4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SDHAF3Q9NRP4 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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