Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PFDN4Q9NQP4 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms