Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1015.5 ms