Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms