Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3GL3Q99963 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms