Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms