Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP3Q96DZ5 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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