Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms