Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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