Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms