Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms