Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPPQ6IPU0 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPPQ6IPU0 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPPQ6IPU0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPPQ6IPU0 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPPQ6IPU0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPPQ6IPU0 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPPQ6IPU0 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPPQ6IPU0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPPQ6IPU0 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPPQ6IPU0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPPQ6IPU0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPPQ6IPU0 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPPQ6IPU0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPPQ6IPU0 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPPQ6IPU0 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPPQ6IPU0 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPPQ6IPU0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPPQ6IPU0 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPPQ6IPU0 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPPQ6IPU0 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPPQ6IPU0 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPPQ6IPU0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPPQ6IPU0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPPQ6IPU0 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPPQ6IPU0 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPPQ6IPU0 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPPQ6IPU0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPPQ6IPU0 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPPQ6IPU0 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms