Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6CQ53S08 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms