Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHB4

SLC5A12, Sodium-coupled monocarboxylate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A12Q1EHB4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC5A12Q1EHB4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms