Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATP6V1FQ16864 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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