Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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