Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SMC1AQ14683 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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