Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HDAC1Q13547 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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