Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC013402.3-201ENST00000438566 451 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 ONECUT1-202ENST00000560699 996 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC066613.2-201ENST00000561007 560 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MKRN4PQ13434 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 RASA2-IT1-201ENST00000507770 612 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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