Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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SCGB2A2Q13296 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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SCGB2A2Q13296 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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SCGB2A2Q13296 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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SCGB2A2Q13296 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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SCGB2A2Q13296 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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SCGB2A2Q13296 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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SCGB2A2Q13296 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SCGB2A2Q13296 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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