Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms