Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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TRIM32Q13049 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM32Q13049 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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TRIM32Q13049 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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TRIM32Q13049 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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TRIM32Q13049 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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TRIM32Q13049 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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TRIM32Q13049 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM32Q13049 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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