Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRN3Q13033 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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