Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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GRIK2Q13002 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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GRIK2Q13002 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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GRIK2Q13002 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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GRIK2Q13002 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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GRIK2Q13002 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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GRIK2Q13002 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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GRIK2Q13002 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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GRIK2Q13002 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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