Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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BNIP1Q12981 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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BNIP1Q12981 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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BNIP1Q12981 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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BNIP1Q12981 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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BNIP1Q12981 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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BNIP1Q12981 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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BNIP1Q12981 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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BNIP1Q12981 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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BNIP1Q12981 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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BNIP1Q12981 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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