Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TROQ12816 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TROQ12816 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TROQ12816 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TROQ12816 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TROQ12816 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TROQ12816 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TROQ12816 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TROQ12816 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TROQ12816 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TROQ12816 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TROQ12816 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TROQ12816 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TROQ12816 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TROQ12816 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TROQ12816 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TROQ12816 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TROQ12816 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TROQ12816 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TROQ12816 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TROQ12816 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TROQ12816 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TROQ12816 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TROQ12816 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TROQ12816 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TROQ12816 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TROQ12816 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TROQ12816 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TROQ12816 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TROQ12816 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TROQ12816 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TROQ12816 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TROQ12816 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TROQ12816 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TROQ12816 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TROQ12816 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TROQ12816 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TROQ12816 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TROQ12816 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TROQ12816 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TROQ12816 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TROQ12816 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TROQ12816 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TROQ12816 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TROQ12816 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TROQ12816 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TROQ12816 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TROQ12816 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TROQ12816 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TROQ12816 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TROQ12816 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TROQ12816 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TROQ12816 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TROQ12816 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TROQ12816 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TROQ12816 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TROQ12816 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TROQ12816 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TROQ12816 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TROQ12816 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
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