Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms