Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC15Q0P6D6 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms